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性傳播疾病的治療要根據不同的性病，進行具體的治療，治療時間較長，主要進行藥物治療，尖銳濕疣可行物理治療，必要時手術切除。
一、藥物治療
1、梅毒：主要藥物有青霉素，青霉素可直接殺滅梅毒螺旋體，是治療各期梅毒的首選藥物。四環素、紅霉素以及第三代頭孢菌素也有一定療效。
2、淋病：無并發癥可用頭孢曲松或環丙沙星等，有并發癥可用頭孢曲松或大觀霉素等進行治療，此類藥物可抑制淋病奈瑟菌的發展。
3、沙眼衣原體尿道炎：一般成人可用左氧氟沙星、莫西沙星、羅紅霉素等，妊娠患者核兒童僅以使用紅霉素和阿奇霉素。此類藥物具有廣譜抗菌作用，抗菌作用強，可緩解癥狀。
4、尖銳濕疣：咪唑莫特乳膏等，此藥的主要作用就是治療成人外生殖器和肛周尖銳濕疣。
5、艾滋病：利用核苷酸反轉錄酶抑制劑、蛋白酶抑制劑等。能夠特異性作用于病毒逆轉錄酶，抑制其活性，從而治療艾滋病。
二、手術治療
尖銳濕疣疣體可以手術治療切除。
三、物理治療
1、尖銳濕疣：采用激光、冷凍、電灼、微波等方式治療，艾滋病、沙眼衣原體尿道炎、淋病、梅毒等無法進行物理治療。
2、光動力治療：適合疣體較小、尿道口尖銳濕疣的患者，也可用于預防復發的治療。
